Il se spécialise avec l'option «municipal environnement», a-t-il dit au début de son témoignage devant la commission Charbonneau. Dès sa sortie de l'université, M. Lalonde est embauché comme chargé de projet dans une firme alors appelée Leroux, Leroux, Nantel, Papin&associés. Il y travaille sous la supervision de René Séguin, qui quitte cependant la firme en 1981 pour fonder sa propre entreprise: René Séguin&associés.

La même année, Michel Lalonde se joint à cette nouvelle entreprise et en devient un associé. L'entreprise se consacre au génie municipal, puis elle ajoute des cordes à son arc en se spécialisant également en transport et en bâtiment. L'entreprise change de nom dans les années 1990 pour celui de Groupe Séguin. En 2001, M. Lalonde devient président de l'entreprise.

En 2008, il fait partie d'une longue liste de signataires qui demandent à la Ville de Montréal et au gouvernement du Québec d'entreprendre la modernisation de la rue Notre-Dame. Il devient le président du conseil d'administration de l'Association des ingénieurs-conseils du Québec en 2008-2009. Il cède ce poste et devient un simple administrateur du conseil en 2010-2011. Groupe Séguin change de nom pour Génius Conseil en 2009. M. Lalonde y occupe le poste d'associé principal et de président.