Steven Kruijswijk a chuté en bordure de la route lors d'une descente périlleuse et le Colombien Esteban Chaves lui a ravi le maillot rose du meneur, à deux jours de la fin du Giro.
Vainqueur vendredi, l'Italien Vincenzo Nibali est passé du quatrième au deuxième rang au classement général, à 44 secondes de Chaves.
«La rage de vaincre m'a transporté. Les derniers jours ont été durs à digérer», a dit Nibali, un favori au départ du Giro, mais dont la dernière semaine a été peu évidente.
Nibali a signé un chrono de près de quatre heures et 20 minutes lors des 162 km entre Pinerolo et Risoul, en France.
L'Espagnol Mikel Landa a fini deuxième, à 51 secondes, suivi de Chaves, à 53 secondes.
Kruijswijk a durement heurté la neige avoisinant le tracé. Il s'en est tiré avec des éraflures mais a dû recevoir de l'aide mécanique et plus tard changer de vélo, prenant beaucoup de retard. Il est finalement arrivé près de cinq minutes après Nibali.
L'incident est survenu peu après le col de l'Agneau, le point le plus élevé du Giro, à 2744 mètres.
Le Néerlandais Kruijswijk est maintenant troisième au total, 1:05 derrière Chaves.
«Je suis heureux d'être en tête, mais l'épreuve de samedi sera éprouvante, a dit Chaves, au sujet du parcours montagneux qui se poursuit. Ce qui est arrivé à Steven est désolant. Il a fait une petite erreur dans la descente mais il a continué de lutter, très courageusement.»
Le Russe Ilnur Zakarin a également subi une chute, plus sévère. Il a dû abandonner pour cause de blessure, possiblement une clavicule brisée.
La 99e présentation du Giro va se conclure dimanche, à Turin.