Selon l'examen indépendant commandé par SNC (T.SNC) et dont les résultats ont été rendus publics en mars 2012, SNC-Lavalin International était au coeur du scandale des commissions irrégulières qui a fortement ébranlé l'entreprise. À la demande de l'ancien vice-président Construction de SNC, Riadh Ben Aïssa, SNC-Lavalin International a versé des commissions totalisant 56 millions US pour décrocher deux contrats.
D'après des sources de La Presse, l'un de ces contrats est celui du futur Centre universitaire de santé McGill (CUSM), d'une valeur de 1,3 milliard. Dans ce dossier, une commission de 22,5 millions US aurait transité par SNC-Lavalin International Tunisie.
M. Ben Aïssa et Pierre Duhaime, qui a été PDG de SNC-Lavalin jusqu'en avril 2012, ont été accusés de fraude, de complot et de fabrication de faux documents en lien avec l'affaire du CUSM.
Selon CBC et la télévision publique suisse, la police helvète enquête par ailleurs sur des paiements suspects de 139 millions qui auraient été faits par SNC-Lavalin International. Les policiers ont interviewé plusieurs ex-dirigeants de l'entité, dont M. Denom. Aucun d'entre eux n'est pour autant soupçonné d'avoir agi illégalement.